為了讓新生有更多的選擇，特別辦理「111學年度轉入金門分部就學一、二年級優惠專案」，讓所有新生都可以享受到移地教學的多元大學生活樂趣。由於金門校區辦學以小班制及學習多元為教育特色，師資與課程和台灣校本部完全接軌，因此特別鼓勵同學可以選擇金門校區就學。
凡申請就讀金門校區的同學，可獲得本校專案獎助學金：在金門就讀期間，輔導通過「學系學習計畫」，每通過一個學習計畫，給予1萬元獎勵金，每學期最多可以獲得5萬元獎勵金，兩年可獲得20萬元獎勵金。另外，還可以申請金門縣政府就學津貼每年新台幣10,000元(未申請政府各項就學補助)及交通圖書券每年新台幣4,000元，且可享有金門縣政府提供之各項福利(學生戶籍須於開學後，遷至本校金門校區)，金門往返台灣的機票，也可享用離島居民的優惠票價；此外，還可申請金門交通卡，免費搭乘金門縣公車、大小金門交通船等。本校其他獎助學金，金門校區學生均可一體適用，其相關訊息：111學年度免學雜費轉入金門分部就學一、二年專案內容、申請表